A Igreja Batista de Montese é fruto do esforço evangelistico da Segunda Igreja Batista de Fortaleza, hoje Igreja Batista de Monte Castelo, localizada nesta Capital à Rua José Candido.

Por volta do ano de 1958, o diácono Melchiades Rodrigues de Sousa, com a sua esposa Maria de Lourdes de Sousa e seus filhos, apoiados pela Igreja Batista de Monte Castelo, iniciaram um ponto de pregação bem debaixo de uma frondosa mangueira que ficava no Bairro Cocorote, área atualmente incorporada ao Bairro Montese. Com o crescimento dos convertidos, tanto crianças como adultos, o ponto de pregação passou a funcionar na residência do irmão Noé Alexandre, na Vila Nossa Senhora de Fátima Nº. 21.

Em 1962, ou seja, dois anos depois, em virtude do crescimento do número dos seus congregados, o trabalho passou a funcionar em um prédio alugado, localizado à Rua Zacarias Gondin S/N, tendo recebido a denominação de Congregação Batista do Cocorote. Nesse período a Congregação contou também com o apoio dos seguintes irmãos, diáconos enviados pela Igreja Mãe: Antonio Francisco, Marcelino Rodrigues e Edson Barata.

Em 1967, encerrado o contrato de locação, a congregação foi transferida para outro prédio alugado, este cito à Rua Cabral de Alencar Nº. 85.

Em 1969, encerrado o novo contrato de locação, passou, então, a funcionar na Rua Barão de Canindé Nº. 405.

Em 1973, em virtude da necessidade de um local mais amplo, mudou-se a sede congregacional para a Rua Capistrano de Abreu, hoje Avenida João Pessoa, Nº. 6427.

Em 1976 o Diácono Melquiades Rodrigues de Sousa, sobrecarregado com as atribuições concernentes à tesouraria da Igreja Batista de Montes Castelo, renunciou à direção da Congregação, tendo sido eleito novo dirigente o Evangelista Alberto Tavares Pereira.

Por volta do ano 1974, com o apoio financeiro da Igreja Batista de Monte Castelo e do Missionário Americano Jerold Evans Golston, então secretário executivo do Campo, além dos recursos oriundos dos dízimos e ofertas dos seus congregados, a Congregação Batista de Montese adquiriu o imóvel no qual foi construído o seu templo próprio. Mesmo antes de terminada a construção do templo, quando somente encontravam-se erguidas as paredes principais e a coberta, o trabalho congregacional, sob a direção do Evangelista Alberto Tavares Pereira, passou a se desenvolvido na sua nova sede.

Em 21 de Julho de 1979, foi constituído um Concilio de Igrejas para examinar a sua real condição de ser constituída em igreja, e, depois de cumprido os tramites legais, por unanimidade, foi aprovada a sua organização com o nome de Igreja Batista de Montese. A diretoria do Concilio ficou assim constituída: Presidente: Pastor Jezimiel Norberto da Silva, Secretário: Pastor Gerson Alves Amorim, Orador: Pastor Fernando Rocha dos Anjos, Entrega da Bíblia: Pastor Samuel de Munguba, oração consagratório: Pastor Gerold Evans Golston. Naquela mesma ocasião foi eleito o primeiro pastor da Igreja Batista de Montese, Jairo de Brito Gomes, e o primeiro vice-moderador, Alberto Tavares Pereira.

Em 2 de Março de 1980, Pastor Jairo de Brito Gomes se exonerou do pastorado , assumindo a presidência da Igreja o vice-moderador Alberto Tavares Pereira.

Em dezembro de 1981, o pastor Josias Alves de Oliveira assumiu o pastorado da Igreja, tendo se exonerado em 18 de Dezembro de 1982.

Em Dezembro de 1982, pastor Edson Lemos Pereira, assume interinamente o pastorado da Igreja, se exonerando em Abril de 1983.

Em Abril de 1983, pastor Jadiel Brandão de Almeida assume o pastorado e se exonera em 21 de Outubro de 1984; assumindo a presidência da Igreja o irmão Alberto Tavares Pereira.

Em 1º de Março de 1986, pastor Francisco Chagas de Sousa assume o pastorado da Igreja, permanecendo até o presente.